Андрей Николаевич Клепач родился 4 марта 1959 года в Москве.
В 1981 году окончил экономический факультет Московского государственного университета имени Ломоносова с дипломом экономиста, преподавателя политической экономии.
В 1996-1997 — доцент кафедры экономических проблем современного капитализма экономического факультета МГУ.
С 1991 до 1998 года — научный сострудник, далее — руководитель лаборатории Института народнохозяйственного прогнозирования РАН.
В 1995-1997 годах — эксперт Российско-европейского центра экономической политики.
В 1999-2004 годах — директор Фонда экономических исследований "Центр развития".
В апреле 2004 года приказом главы Министерства экономического развития и торговли РФ Германа Грефа назначен руководителем департамента макроэкономического прогнозирования ведомства.
В феврале 2008 года назначен на должность заместителя главы Минэкономразвития России, курирующего вопросы прогнозирования, развития секторов экономики, стратегического планирования, а также бюджетирования.
С июня 2008 года по июль 2014 года работал заместителем министра экономического развития Российской Федерации.
В июле 2014 года стал главным экономистом Внешэкономбанка.
Кандидат экономических наук.
